Prospective génomique environnementale
Avec le développement de nouvelles générations de séquençage (NGS), aussi appelées nouvelles technologies de séquençage (NTS), ce début de 21" siècle est marqué par la levée d'un verrou technologique majeur en biologie. Parce qu'elles augmentent significativement le niveau de production des séquences nucléotidiques par rapport au séquençage classique (Sanger), les NGS modifient de manière irréversible les recherches en écologie, évolution et sciences de l'environnement. Cette révolution technologique permet l'émergence d'un champ disciplinaire jusque-là inaccessible, la génomique· environnementale.
Elle appréhende la structure et le fonctionnement des différentes composantes des génomes et métagénomes (ADN et ARN) de l'ensemble des organismes; elle permet, en association avec d'autres approches à haut débit dites • omiques et métaomiques •, une compréhension intégrée des populations, communautés et écosystèmes présents et passés. La génomique environnementale est considérée ici dans son acceptation la plus large intégrant les approches quantitative et qualitative de la complexité du vivant et de ses interactions aux différentes échelles de temps et d'espace.