Philippe VandenkoornhuyseProfesseur à l’Université de Rennes
Philippe Vandenkoornhuyse, l'écologie microbienne pour une agriculture durable
Professeur à l’Université de Rennes et membre du laboratoire Écosystèmes, Biodiversité, Évolution (ECOBIO – CNRS / Université de Rennes), Philippe Vandenkoornhuyse est reconnu à l’échelle internationale pour ses recherches sur le microbiote endosphérique des plantes ainsi que l’évolution des symbioses. Il a notamment contribué à faire émerger le concept d’holobionte végétal, modifiant la compréhension des symbioses et de l’organisation du vivant. Ses travaux s’étendent du génome aux paysages microbiens, avec une ambition : mieux intégrer la diversité microbienne dans les pratiques agricoles. Figure structurante de la génomique environnementale, Philippe Vandenkoornhuyse dirige une plateforme du réseau Biogenouest et de l'infrastructure nationale AnaEE et co-dirige le réseau thématique nationale GREENomics. Chercheur prolifique et formateur engagé, il œuvre par ailleurs à la structuration de l’enseignement supérieur en écologie.
Au sein du laboratoire Écosystèmes, Biodiversité, Évolution (ECOBIO – CNRS / Université de Rennes), il développe une approche intégrative du vivant fondée sur l’analyse du microbiote végétal. Il a ainsi joué un rôle central dans la définition du concept d’holobionte végétal, en montrant que les plantes fonctionnent en association intime avec des communautés microbiennes structurées et dynamiques. Après une thèse soutenue à l’Université de Nancy en 1998, il construit un parcours original où se croisent écologie, biologie évolutive et génomique. Ses recherches introduisent des concepts innovants sur l’evolution des symbioses, l’evolution des dependances, la dysbiose végétale et a contribué à la transposition des logiques de l’écologie du paysage au monde microbien.
Il est également l’un des rares chercheurs à relier les hypothèses évolutives aux interactions microbiennes concrètes. Convaincu que « la fertilité ne se définit pas à la concentration d’éléments minéraux dans le sol et doit prendre en compte l’efficacité fonctionnelle des micro-organismes », il explore les conditions d’émergence de nouvelles symbioses bénéfiques entre plantes et microbiotes. Il a contribué à rendre accessibles des technologies de séquençage de pointe via des plateformes qu’il coordonne à l’échelle régionale (Biogenouest) et nationale (GREENomics). Auteur de publications majeures dans Science, PNAS, New Phytologist ou Trends in Plant Science, Philippe Vandenkoornhuyse est également un pédagogue engagé, à l’origine du master international IMABEE. Il a aussi dirigé le master "Biodiversité, écologie et évolution" de Rennes ainsi que le parcours "Ecologie fonctionnelle comportementale et évolutive", au sein duquel plus de 350 étudiants ont été formés en une décennie.
« Être enseignant-chercheur ? C’est le plus beau métier du monde. Je n’en connais pas beaucoup d’autres grâce auxquels on peut se dire, chaque matin « là, il y a quelques choses de nouveau à explorer », conclut celui qui compte bien faire en sorte que ses travaux permettent d’envisager une « agriculture réellement durable ».